沿革
| 1957（昭和32） | 運輸省（現国土交通省）の海上航行安全審議会が「海難防止に関し啓発指導活動のための新たな組織が必要」答申 |
|---|---|
| 1958（昭和33） | 社団法人日本海難防止協会発足 |
| 1968（昭和43） | 海洋汚染防止事業の追加 |
| 1972（昭和47） | 公害調査部（現海洋汚染防止研究部）を設置 |
| 1981（昭和56） | 人事院から「研究機関」の指定を受ける |
| 1982（昭和57） | 企画部（現企画国際部）、海上安全研究部、海上交通研究部を設置 |
| 1983（昭和58） | ロンドン連絡事務所を開所 |
| 1996（平成08） | シンガポール連絡事務所を開所 |
| 1998（平成10） | 研究統括本部を設置 |
| 2002（平成14） | 富山連絡事務所を開所 |
| 2012（平成24） | 内閣府から公益社団法人としての認定を受ける |
| 2015（平成27） | ミクロネシア３国担当を配置 |